Les laboratoires d’hydrobiologie ont été créés en 1971 au sein du ministère de l’agriculture pour appuyer les expertises en matière d’analyses du domaine de l'eau et des milieux aquatiques (ces laboratoires faisaient aussi de la chimie jusque dans le début des années 2000). Cette compétence a transité par diverses structures régionales de l’État dépendantes du ministère en charge de l’environnement avant d’aboutir à l’OFB en 2023.

Les directions interrégionale et régionales de l’Office Français de la Biodiversité (OFB) PACA-Corse, Occitanie et Auvergne-Rhône-Alpes sont impliquées dans la connaissance des milieux aquatiques, par la production de données, d’expertises et d’avis, en particulier pour l’évaluation de l’état écologique des eaux, en application de la Directive Cadre Européenne sur l’eau (DCE).

Les laboratoires d’hydrobiologie de l'OFB réalisent des prélèvements et déterminations faunistiques (invertébrés benthiques) et floristiques (diatomées et macrophytes) des cours d’eau dans le cadre des réseaux de suivi du programme de surveillance des masses d’eau, en partenariat avec les Agences de l'Eau.

Le présent portail a pour objectif de mettre à disposition les données hydrobiologiques produites pour le compte des Agences de l’Eau Rhône Méditerranée Corse, Adour Garonne et Loire Bretagne pour les 3 compartiments invertébrés, diatomées et macrophytes sur les cours d’eau des 3 régions citées précédemment.

Différentes possibilités de consultations sont offertes aux lecteurs :

• accès aux informations générales sur la localisation des stations (photos, coordonnées, cartes, lien vers les données valorisées des agences, voir ci-dessous) ;
• consultation ou téléchargement des données hydrobiologiques brutes ;
• consultation ou téléchargement des indices biologiques sous forme de tableaux de synthèse, de graphiques, ou de cartes de synthèse.

La directive du 23 octobre 2000 adoptée par le Conseil et par le Parlement européen définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grands bassins hydrographiques au plan européen. Cette directive fixe des objectifs ambitieux pour la préservation et la restauration de l’état des eaux superficielles (eaux douces et eaux côtières) et pour les eaux souterraines.

La directive cadre donne la priorité à la protection des eaux, en demandant de veiller notamment à la non dégradation de la qualité des eaux et d’atteindre, pour 2015 initialement, un bon état général tant pour les eaux souterraines que pour les eaux superficielles, y compris les eaux côtières. Des reports étaient rendus possibles aux échéances 2021 et 2027, sous certaines conditions à justifier. En application de la directive-cadre européenne sur l’eau, une définition du bon état écologique a été établie par types de masses d’eau, à partir des résultats de stations de référence.

Pour les cours d'eau, le processus d'évaluation de l’état d’une masse d’eau se déroule de la façon suivante :

• calcul de l'état écologique, selon le principe de l’élément déclassant, en prenant en compte les éléments biologiques mesurés : ichtyofaune (poissons), faune benthique invertébrée, flore aquatique (diatomées et macrophytes), à partir des indices en vigueur développés pour chaque élément, et de leur écart par rapport aux conditions de référence établies par types de masses d’eau. Les éléments physico-chimiques généraux et les polluants spécifiques de l’état écologique venant en soutien aux éléments biologiques sont intégrés à l'ensemble. Le paramètre "hydromorphologie" est pris en compte pour l'évaluation du "très bon état". L'état écologique se décline en 5 classes, de “très bon” à “mauvais”.


• calcul de l'état chimique, en évaluant le respect ou non des normes de qualité environnementale fixées par les directives européennes pour une cinquantaine de substances prioritaires ou dangereuses. L'état chimique se décline en 2 classes : “bon” ou “mauvais”.

Les chroniques de données et règles d’agrégation sont définies par l’arrêté du 25/01/2010 modifié relatif aux méthodes et critères d’évaluation, en vigueur au moment des calculs.

L'état global se calcule par l'agrégation des 2 états : le bon état global est atteint lorsque l'état écologique et l'état chimique sont au moins bons.

A l'échelle nationale

Le portail "Eaufrance" est le point d’accès unique à toutes les informations et les données publiques relatives à l’eau et aux milieux aquatiques.
› eaufrance.fr
Le site Naïades constitue la base de référence pour les données de qualité des eaux de surface continentales (cours d’eau et plans d’eau).
› naiades.eaufrance.fr
Les données élaborées présentées sur ce site sont issues de la base Naïades qui fait référence.

A l’échelle des districts hydrographiques

Chaque bassin est doté d’un portail qui a pour objectif de diffuser des informations sur l’eau et les milieux aquatiques spécifiques à son territoire. Les thématiques abordées peuvent être différentes d’un bassin à l’autre. Les portails de bassin disposent de nombreux outils de visualisation de données : visions tabulaire, graphique, cartographique. Ils permettent également de télécharger des jeux de données. Les données récoltées par les Agences de l’eau sont bancarisées dans la base NAIADES.

Bassin Rhône-Méditerranée

› rhone-mediterranee.eaufrance.fr

Bassin Adour-Garonne

› adour-garonne.eaufrance.fr

Bassin Rhône-Méditerranée

› donnees-documents.eau-loire-bretagne.fr/home/eaux-et-milieux-aquatiques/cours-deau.html